Tema: Epigenética de la diabetes tipo 2 y resultados relacionados con la diabetes en el estudio Strong Heart
Illumina MethylationEPIC BeadChip: Se utilizó esta tecnología para medir la metilación del ADN en casi 800,000 loci genómicos en células blancas de la sangre. La técnica involucró la conversión bisulfito de ADN y la posterior cuantificación de la metilación en sitios CpG.
Modelos Estadísticos (ISIS-AENET y Regresión Cox): Se aplicaron métodos estadísticos avanzados como ISIS-AENET (Sure Independence Screening coupled with Adaptive Elastic-Net) para identificar DMPs asociados con glucosa en ayunas y HOMA-IR. Además, se utilizaron modelos de regresión de Cox para evaluar la asociación prospectiva de estos DMPs con la incidencia de diabetes tipo 2.
Resultados:
1. Se identificaron 358 DMPs asociados con glucosa en ayunas o HOMA-IR, de los cuales 49 se asociaron con la incidencia de diabetes, aunque ninguno superó el umbral de significancia después de la corrección por comparaciones múltiples.
2. Algunos de los genes asociados a los DMPs incluyen SREBF1 y ABCG1, que están implicados en el transporte de colesterol y fosfolípidos, y en la sensibilidad a la insulina, respectivamente. Estos genes también han sido identificados en otros estudios de asociación epigenómica con la diabetes, lo que sugiere una firma epigenómica común en diferentes poblaciones.
3. HDAC1 fue identificado como un nodo clave en las redes de interacción proteína-proteína, lo que resalta su relevancia en la regulación epigenética asociada con la diabetes.
